在google上看到

一般gtk軟體下可以使用<ctrl>+<shift>+u開啟unicode輸入模式

不過我自己嘗試是沒有辦法

請問這是因為gcin的關係嗎？

您所說的應該是指ISO 14755 支援。
我不是專家，但是從安裝unicode rxvt的經驗來看，在configure時就可以指定是否要具備ISO 14755 支援的功能，由此可見您無法使用前述的方式輸入y資料其實與gcin無關。
請參考。

gcin 有內碼輸入法可以用